A Szentatya kubai látogatásának második napján, kedden reggel 8 órakor szentmisét mutatott be a Santiago de Cuba-i szálláshelyén, a Nagy Szent Vazul szeminárium kápolnájában, majd negyed 10-kor búcsút vett az intézménytől és vendéglátóitól. Ezt követően az El Cobrei Szeretet Szűzanya nemzeti kegyhelyre látogatott, ahol Santiago de Cuba érseke és a szentély rektora fogadta.

A Kubában legnagyobb tiszteletnek örvendő zarándokhely története kötődik az ország társadalmi és politikai történéseihez. 1606-ban három halász (két őslakos, Juan és Rodrigo de Hoyos, valamint egy néger rabszolga, Juan Moreno) talált rá a tengerben lebegő Mária kegyszoborra, amelyen ez volt olvasható: „Én vagyok a Szeretet Szűzanyja”. A szobrot az El Cobre-i rézbányához vitték, ahol 1674-ben megépült az első kegyhely. 1801-ben itt olvasták fel az El Cobre-ban dolgozó rabszolga bányászok felszabadítására írt kiáltványt, majd 1868-ban Carlos Manuel de Céspedes, a rabszolgaság eltörlésének és Kuba függetlenségének szószólója zarándoklatot tett a kegyhelyre és imádkozott Mária kegyszobra előtt Kuba szabadságáért. 1898-ban szentmisét mutattak be a sziget felszabadításáért, majd 1927-ben, XV. Benedek pápa Kuba védőszentjévé nyilvánította a Cobrei Szeretet Szűzanyát. 1927-ben szentelték fel a jelenlegi kegyhelyet, majd 1952-ben a kegyszobrot zarándoklatra vitték körbejárva egész Kubát a hit és remény üzeneteként. 1977-ben VI. Pál pápa az El Cobre-i kegyhelynek a Bazilika Minor címet adományozta. Az alkalomra kijelölt különleges pápai küldött Bernardin Gantin benini bíboros volt, a Püspöki Kongregáció akkori prefektusa.

XVI. Benedek pápát a kegyhelyre való megérkezése közben egy kubai kórus várta az Ave Maria-t énekelve. A Szentatya az Oltáriszentség előtt térdet hajtott, majd a Szűzanya kegyszobra elé járult, ahol szintén térdre borulva gyertyát gyújtott és elimádkozta a Cobrei Szeretet Szűzanya imáját. Ez a jubileumi év egyik szertartása, amellyel a zarándokok teljes búcsút nyerhetnek. Ezt követően elénekelték a Szeretet Szűzanya himnuszt.

A pápa a kegyszobornál tett tiszteletét követően a bazilika előtt köszöntötte és megáldotta a jelenlévő híveket. Elmondta, hogy zarándokként jött a „Mambisa”-nak is nevezett Szűzanyához, amelynek jelenléte a Mennyek ajándéka a kubaiak számára. „Nagy szeretettel vagyok irántatok” – mondta a Szentatya a jelenlévő híveknek – „és arra kérlek benneteket, hogy közvetítsétek szeretetemet embertársaitok számára, hogy mindannyian felfedezzék a hit nagy erejét és vigaszt adó mivoltát. Tudassátok mindenkivel, hogy Isten Anyjára bíztam hazátokat, hogy a megújulás és a remény útját járjátok a kubaiak érdekét szolgálva ezáltal. Imádkoztam a Szűzanyához a szenvedőkért és azokért, akik távol vannak családjuktól és nehézségekkel küzdenek, továbbá a fiatalokért, hogy Krisztus valódi barátaivá váljanak. A Cobrei Szűzanya előtt fohászkodtam az afrikai származású kubaiakért és Haiti népéért, amely még ma is a két évvel ezelőtti hatalmas földrengés következményeitől szenved. A Szűzanya példáját követve minden kubait arra bátorítok, hogy életét Jézus Krisztusra építse, munkálkodjon az igazságosságért, álljon a szeretet szolgálatába. Azt kívánom, hogy senki és semmi ne vehesse el tőletek a belső örömet, amely a kubai lélek ismertetőjegye. Isten áldjon meg benneteket!”

Benedek pápa ezt követően a Santiago de Cuba-i nemzetközi repülőtérre ment, ahol búcsút vett a helyi hatóságok képviselőitől, majd Havannába ind